对于资政院通过的财政预算，各省督抚以其削减经费，群起反对，军机大臣也在暗中支持。溥伦力称既经全院议决，又得政府同意，万无破坏之理，坚持执行。

此后，溥伦因资政院上奏的议案多未收到效果，觉得自己没有尽到责任，深感惭愧，甚为灰心。1911年1月11日资政院闭会以后，便向载沣提出辞职。载沣不准。溥伦决定将资政院未结各案清理完再行请退。接着修改资政院章程，见奕劻等人出而干预，反而激起了他的勇气，打消了退意。对人说：“幸本总裁于监国（载沣）前尚见信用，遇事可以直陈，拟将从前退志取消，始终维持资政院，至于议院（国会）成立。倘竟从此引退，另易议长，恐与朝廷诸多隔膜，则资政院之将被摧残，势必更觉不堪设想。”（《伦贝子始终维持资政院》，《盛京时报》1911年2月14日）

然而，溥伦虽想继续维持资政院，军机大臣却不容他维持下去。军机大臣当初之所以同意简任他为总裁，只因他年纪较轻，阅历较少，以为必能俯首听命。不意开院以后，他事事力持大体，尽心职守，维持宪政，遵照民主原则议事，与议员行动基本保持一致，感情亦颇融洽。军机大臣不过视资政院为一件装饰品，见其不服从指挥，于是由讶而怨，由怨而怒，深悔委任非人，有养虎伤身之惧。故在闭会之前，就把议员的“嚣张”“胡闹”，归咎于溥伦的纵容，准备换人。1911年3月，资政院多数议员因外交失败要求召开临时会议，溥伦与军机大臣协商。奕劻以其不能压制议员，怒不可遏，忿然说：“又招惹他们多生事端，决不赞成。”（《时报》，1911年3月17日）决计将其调离。沈家本是著名的法律专家，尽力协助溥伦，也不为军机大臣所容，遂奏请改派正副总裁。3月22日，朝廷下令调溥伦任农工商部尚书，沈家本任法部左侍郎；以大学士世续为资政院总裁，学部右侍郎李家驹为副总裁。

不愿当傀儡的世续

世续是出名的守旧官僚，李家驹为政府的第一红人，简任他们为正副总裁，意图十分明显，引起社会极大反响。《大公报》评论说：“此次之更动，实出于政府一二人之私意。在政府意中，不过示威国民，俾后之为总裁者鉴于前车，不敢显与为抗，于以保专制于不朽耳！”（《论资政院总裁之更动》，《大公报》1911年3月24日）

世续接任总裁以后见到多数议员要求召开临时会议，认为召开临时会议解决上届遗留的问题也有必要，就去找军机大臣商议。奕劻等没有表态，要他自己拿主意。他回去大发雷霆，公开讲：“他们既强以此重任委之于我，遇事仍不负责，是欲以我为全国舆论之公敌。我即不作此总裁，亦不能为他们之傀儡。”（《大公报》1911年4月1日）遂上奏召开临时会议，但以奕劻为首的皇族内阁没有同意。其后皇族内阁深恐第二届会议时难以答复议员的质问，演出更为激烈的弹劾倒阁风潮，再次提出修改院章，对资政院职权严加限制。世续与李家驹意见不合，又见议员对修院章极其不满，预料将来开会时很难措置，决心辞职，实践前言，从7月下旬开始连请病假。10月30日，载沣准其辞职，任命李家驹为总裁。

世续思想守旧，在维护宪政等方面均不如溥伦开明。可是，他具有独立的人格，这一点就非常人所及，值得称道，不能因其思想守旧而加以抹杀。